Реакция иммунофлуоресценции используется для быстрого обнаружения цитомегаловирусных антигенов в мазке и позволяет быстро диагностировать инфекцию. Анализ проводится на отрыв лекарств или соскоб мочевыводящих путей, сыворотку крови. При небольшом количестве вирусных антигенов в препарате можно получить ложноотрицательный результат и при большом присутствии других микроорганизмов, способных давать люминесценцию при флуоресцентной микроскопии, ложноположительные результаты.